Global and regional source attribution of Shiga toxin-producing Escherichia coli infections using analysis of outbreak surveillance data

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dc.contributor.author

Pires, Sara M.

Majowicz, Shannon

Gill, Alexander

Devleesschauwer, Brecht

dc.date.accessioned

2024-03-21T15:56:44Z

dc.date.available

2024-03-21T15:56:44Z

dc.date.issued

2019-07-08

dc.description.abstract - en

Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) infections pose a substantial health and economic burden worldwide. To target interventions to prevent foodborne infections, it is important to determine the types of foods leading to illness. Our objective was to determine the food sources of STEC globally and for the six World Health Organization regions. We used data from STEC outbreaks that have occurred globally to estimate source attribution fractions. We categorised foods according to their ingredients and applied a probabilistic model that used information on implicated foods for source attribution. Data were received from 27 countries covering the period between 1998 and 2017 and three regions: the Americas (AMR), Europe (EUR) and Western-Pacific (WPR). Results showed that the top foods varied across regions. The most important sources in AMR were beef (40%; 95% Uncertainty Interval 39–41%) and produce (35%; 95% UI 34–36%). In EUR, the ranking was similar though with less marked differences between sources (beef 31%; 95% UI 28–34% and produce 30%; 95% UI 27–33%). In contrast, the most common source of STEC in WPR was produce (43%; 95% UI 36–46%), followed by dairy (27%; 95% UI 27–27%). Possible explanations for regional variability include differences in food consumption and preparation, frequency of STEC contamination, the potential of regionally predominant STEC strains to cause severe illness and differences in outbreak investigation and reporting. Despite data gaps, these results provide important information to inform the development of strategies for lowering the global burden of STEC infections.

dc.description.abstract-fosrctranslation - fr

Les infections à Escherichia coli (STEC) productrices de shigatoxines représentent un fardeau sanitaire et économique important dans le monde entier. Pour cibler les interventions visant à prévenir les infections d’origine alimentaire, il est important de déterminer les types d’aliments conduisant à des maladies. Notre objectif était de déterminer les sources alimentaires de STEC à l'échelle mondiale et pour les six régions de l'Organisation mondiale de la santé. Nous avons utilisé les données des épidémies de STEC survenues dans le monde pour estimer les fractions d'attribution des sources. Nous avons classé les aliments en fonction de leurs ingrédients et appliqué un modèle probabiliste utilisant des informations sur les aliments impliqués pour en attribuer la source. Des données ont été reçues de 27 pays couvrant la période entre 1998 et 2017 et de trois régions : les Amériques (AMR), l'Europe (EUR) et le Pacifique occidental (WPR). Les résultats ont montré que les principaux aliments variaient selon les régions. Les sources les plus importantes de RAM étaient le bœuf (40 % ; intervalle d'incertitude de 95 % : 39 à 41 %) et les produits agricoles (35 % ; 95 % : UI, 34 à 36 %). En EUR, le classement était similaire mais avec des différences moins marquées entre les sources (bœuf 31 % ; 95 % UI 28-34 % et produits 30 % ; 95 % UI 27-33 %). En revanche, la source la plus courante de STEC dans la WPR était les produits agricoles (43 % ; 95 % UI 36 à 46 %), suivis par les produits laitiers (27 % ; 95 % UI 27 à 27 %). Les explications possibles de la variabilité régionale incluent les différences dans la consommation et la préparation des aliments, la fréquence de la contamination par les STEC, le potentiel des souches de STEC prédominantes au niveau régional à provoquer une maladie grave et les différences dans les enquêtes et les rapports sur les épidémies. Malgré les lacunes dans les données, ces résultats fournissent des informations importantes pour éclairer l’élaboration de stratégies visant à réduire le fardeau mondial des infections à STEC.

dc.identifier.uri

https://science-ouverte.canada.ca/handle/123456789/2178

dc.language.iso

en

dc.publisher

Cambridge University Press

dc.subject - en

Health

Health and safety

dc.subject - fr

Santé

Santé et sécurité

dc.subject.en - en

Health

Health and safety

dc.subject.fr - fr

Santé

Santé et sécurité

dc.title - en

Global and regional source attribution of Shiga toxin-producing Escherichia coli infections using analysis of outbreak surveillance data

dc.type - en

Article

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